米国環境保護局によるバイオディーゼル燃料の 排ガス成分および環境と健康への影響に関する報告（下図）では、 バイオディーゼルの混合比率が高いほど、NOxの排出量は増加しますが、 PM、CO、HCの排出量は減少しました。 軽油とバイオディーゼル100％を比較すると、 バイオディーゼルは軽油にくらべてNOxが10％上昇する反面、 COと PMは約50％低下し、 HCでは約70％近く減少しています。 よって、バイオディーゼルは軽油よりも排出量が多くなる項目もあるものの、 総じて大気汚染物質の発生を抑えることができる、とみることができます。